《5亿年，岩石里的生命奇迹（第一季）》将从一块块化石入手，以脊椎动物演化史上的里程碑事件为线索，选取中国境内最具代表性的化石，结合最前沿的研究成果，通过现代复原手段，带你见证华夏大地的古脊椎动物家族如何一路走来，谱写出一曲波澜壮阔的地球生命史诗。 　　本季共记录了15种古脊椎动物： 　　凤姣昆明鱼 　　浙江曙鱼 　　奇迹秀山鱼 　　初始全颌鱼 　　梦幻鬼鱼 　　山西山西鳄 　　贵州龙 　　喜马拉雅鱼龙 　　半甲齿龟 　　许氏禄丰龙 　　马门溪龙 　　华丽羽王龙 　　诸城中国角龙 　　哈密翼龙 　　小盗龙

在一所监狱的混合牢房中，一名少年正骑在一名青年身上用绳子勒紧他的脖子。看守发觉后立刻将少年拉开，但那名青年已经断了气。行凶后的少年神情冷漠，只是反复叨念着：“我做到了，我做到了……” 　　两名警察开始调查这桩奇特的杀人事件。行凶者有吉淳原是在GAY吧打工的男妓，在遭客人虐待后将其杀死，由此入狱。而被害人香月史郎则是一个在不良环境中长大的混混，从小就打架抢劫无恶不作，最终打死了人。他和有吉在同一天被押入这家监狱。沉默冷淡的有吉和粗暴易怒的香月性格正相反，但两人的关系却十分亲密。在狱中，香月一直充当着有吉的保护人。 　　为何有吉要杀死善待自己的香月？两名警察围绕杀人动机之谜继而展开了进一步探查。而狱中囚犯们的证词杂乱无章，甚至相互矛盾。新调来的监狱所长似乎也与这起事件有关，数年前其妻被香月施暴后自杀，因而他一直对香月怀恨在心。 　　事件的真相仿佛深藏在迷雾之中，有吉的真意究竟是什么呢？